随着登州陷落叛军力量得到飞速提升，不但部队得到极大的扩充，原本的近两万人加上张焘，耿忠明的近七千人以及投降的明军和裹挟的百姓，部队猛增到四万多人，不但有了充足的粮饷，还有了坚城可以作为根据地，羽翼已经丰满，不是刘凡区区不到千人可以撼动的了。
登州可以说是大明最大最先进的铸炮基地，登州城中不但有明末最厉害的火炮专家孙元化精心打造的二十几门红夷大炮以及上百门未来及使用的西洋炮，还有大明规模最大的铸造火炮的工匠以及二十多名受孙元化招募的葡萄牙炮手和翻译。登州的陷落使其全部落入叛军手中，孔有德叛军瞬间有了大明最多的火炮，连宁远前线也不及。
刘凡最担心的事情还是发生了，现在山东已经没有独立剿灭叛军的实力了，必须请求崇祯调派援军才能继续围剿，无奈之下刘凡赶紧给崇祯写奏折，说明情况，增派援军。而他自己只能待在青州城继续练兵。
这时在京城得到消息的崇祯怒不可歇，当即罢免了孙元化登莱巡抚的职位，并任命谢琏为副都御使巡抚登莱，罢免余大成山东巡抚的职位，调徐从志接任，总揽军政负全权责围剿叛军，命令总兵刘同柱率兵自北京南下，四川总兵邓圮、王洪率兵自昌邑而出，并调关外精锐四千八百多人入关平叛，让总兵金国奇担任将领，统帅副将靳国臣、刘邦域，参将祖大弼、祖宽、张韬，游击柏永福以及旧总兵吴襄等人，让宦官高起潜监督、护守军饷，汇合山东共同围剿孔有德叛军。
崇祯五年元月二十日，孔有德叛军攻陷登莱重镇黄县和招远，控制了登州大部分地区。战线延长至莱州城附近，刘凡奉命前去增援莱州城。经过三日行军，刘凡元月二十三日到达莱州城，并在莱州城见到新任的山东巡抚徐从志以及登莱巡抚谢琏和莱州巡抚朱大年等人。刘凡在城中受到三人的热情接待，是夜三人在朱大年家中设宴招待刘凡并商讨叛军情况。期间三人畅谈良久刘凡也对三人的爱国情操感染对他们充满了好感。席间徐从志询问刘凡关于叛军的看法以及未来叛军可能的动态。刘凡早就知道不久叛军就会攻城，赶紧说出了自己的担忧，刘凡认为叛军攻陷登州后急于把战线向前推进以增加登州的战略缓冲，莱州城作为山东有名的重镇战略位置及其重要，叛军不久就会进攻，而且叛军攻陷黄县和招远恰恰证明了这点，三人听完刘凡的分析认为他说的很有道理，刘凡乘机献策要广积粮，并且把莱州城附近的村民都迁移到城中运走粮食坚壁清野，做好长期困守莱州的打算。
次日，在朱大年的主持下莱州开始了坚壁清野的计划，刘凡与徐从志谢琏一起巡视城防，加固城墙，等待叛军的到来。
崇祯五年元月二十八日，孔有德，李九成携三万大军包围莱州城，次日，叛军开始攻城。孔有德先驱使炮灰部队攻城，并且动用全部红夷大炮二十门及西洋炮近百门的强大火力轰击城墙，大炮轰击城墙，砖石被击起飞溅的到处都是，打在守军身上立刻毙命，霎时间城头被烟雾笼罩，守军面对如此强大的火力伤亡惨重不得在藏兵洞躲避等待。几轮炮击后，叛军架着云梯开始了惨烈的攻城战，叛军喊着口号冒着箭雨落石冲上城头和守军开始争夺战，狰狞的面孔，带血的刀剑，低沉的嚎叫，弥漫的烟尘，整个莱州城都被这种原始搏杀的惨烈气息所笼罩所湮灭。战争，却依然持续。嘹亮的嘶喊惨叫，动人心弦。叛军人数众多犹如蚁附，他们口中，发出了震动天地的嘶吼。这种喊声，互相传染，互相激励，消褪了心中许多莫名的恐惧。空中箭矢狂飞，拖着长声的箭雨如蝗虫过境般纷纷划破晴空，只见不断地兵士中箭倒地。叛军刚登上城墙，即刻被数名守军蜂拥持刃迎上，惨叫着跌到城下摔成肉泥。
战斗从清晨持续到傍晚，无论是进攻一方还是守军一方都是伤亡惨重，叛军依然没有攻上城头，眼见天色已晚孔有德无奈之下才鸣金收兵，看着叛军如潮水般的退去，刘凡心中没有任何高兴的地方，因为他知道历史，假如按照历史来说的话这样的攻城还要持续很久，也会越来越惨烈，历史中的莱州城被围困长达四个月之久，真不知道他们是怎么坚持下来的，刘凡到现在才算是见到了古代战争的残酷和惨烈，这肢体横飞的场面实在是太震撼人心了。刘凡心中充满了焦急希望崇祯的命令会使这些自私愚蠢的文官听命吧，不然的话刘凡也不知道他能坚持到什么时候。
惨烈的战斗依然还在继续，经过长达半个月的攻坚战，刘凡手下的破虏军也是伤亡大半，就连刘凡手下的哨官王永发也因保护刘凡被叛军杀死了，接替他的李小虎也才战斗激烈的某一日重伤，不能不被抬走修养，刘凡现在手下就剩下武涛一个哨官了，破虏军战营损失了三分之一的兵力，辅兵营更惨几乎伤亡过半，战斗最惨烈的时候叛军几乎攻上城头，幸得山东巡抚亲自登上城头指挥作战，守军才堪堪守住城墙没有被攻破，然而在三天之前的一次攻城战中这位忠心英勇的巡抚却被一发炮弹击中当场身亡了，刘凡朱大年谢琏强忍悲痛，草草安葬了徐从志继续指挥守城。在这半个多月的时间刘凡四人并肩作战结下了深厚的友谊，对于徐从之这为长者的去世刘凡也是充满了惋惜，刘凡知道历史也曾提醒过徐从志要注意，但是战争发展到这种程度已经不是个人的力量可以扭转的了，徐从志还是向历史一样牺牲了。刘凡有时候在问自己真的可以拯救大明吗？为什么他努力到现在依然没有改变什么，孔有德依然占据了登州，荼毒了山东大部，在不久的将来他还要带着先进的火炮投降后金，充当满洲人的刽子手和带路党，而刘凡他什么也做不了！